Après La Cathédrale céleste, La Naissance d'Hermès voit la petite communauté de spationautes s'organiser sur la Lune, futur lieu de transit entre la Terre et Mars. Afin de paver le chemin d'autres explorateurs, il s'agit de planifier l'habitat extra-terrestre, construire une base permanente, cartographier la surface lunaire et en analyser les minéraux, envisager l'exploitation des astéroïdes. Il faut aussi prévoir l'alimentation en eau, hydrogène et oxygène, programmer des stations en orbite lunaire et des expériences scientifiques dans le vide spatial, recenser les objets célestes et étudier la vie secrète des étoiles...